生物法除磷的最大优点就是很少采用化学药剂或完全不采用化学药剂，从而节约大量资金，而且还会产生一些相关益处：

　　一、不产生化学污泥:化学除磷会产生化学污泥，反过来又会导致总污泥产量的增加，使致污泥处理、污泥排放和污泥管理费用的增加；同时还会对脱氮产生影响。

  二、不会破坏剩余污泥的脱水性。当采用化学方法时，磷酸盐以带有结晶水的金属磷酸盐的形式贮存。这就在理论上解释了这些含磷酸盐的沉淀物不易进行脱水的原因。其中脱水性能的破坏程度由所采用的化学试剂的种类和剂量所决定。相反，当采用生物法除磷时，磷酸盐以不带有任何结晶水的磷酸钾或磷酸镁(聚磷酸盐)的形式贮存，故其产生的剩余污泥具有较好的脱水性。而且，SVI对污泥的脱水性有很大的影响。

  三、降低出水中的盐度。采用化学沉淀的方法，负价离子(氯和硫)存在于水相中，导致受纳水体盐度的增加。

  四、对硝化过程抑制较小。金属酸盐的投加会导致碱度降低。其中碱度决定混合液缓冲能力。pH的大幅降低(例如小于6.5)会抑制硝化反应。

  五、对总氮的去除影响很小。当采用前置化学沉淀的方法时，很大一部分COD会随初沉淀泥一起被去除。因此在活性污泥工艺中，初沉池的出水就成为反硝化作用的限制性因素。