在活性污泥中的磷主要以三种形式存在：

  在正常情况下有机磷占活性污泥细胞干重的1%-2%，在设有前置沉淀的污水处理系统中污泥含磷百分比为2%左右。磷在初沉污泥中的含量为1%一1.5%。在不设前置沉淀的活性污泥系统中，有机磷百分比通常在2%以下。

  二、产生并最终在聚磷菌中贮存的聚磷酸盐

  一个聚磷菌最多能含有大约50%的聚磷酸盐。这一比值与根据总悬浮固体得出的聚磷酸盐中含磷10%一15%相当。由于聚磷菌只占活性污泥的很小一部分，因此活性污泥中的聚磷酸盐含量会很低。以醋酸盐作为单一碳源且含有过量聚磷酸盐的活性污泥系统中，污泥中的总磷含量会达到10%一15%。这一百分比与其他报道中所述的聚磷菌含磷饱和值0.15.0.2gP/ gCOD . PAO是相符的。

  三、物理化学方式固定的磷，沉淀的磷，金属络合的磷